Hubo cambios en la modalidad de trabajo y organigrama pero nunca dejó de funcionar. Por estos días se están centralizando las acciones en la "segunda ola" de la pandemia. 

Hubo polémica a nivel local y provincial en relación al trabajo de los Centros de Operaciones de Emergencia y la posibilidad de su disolución. Hace días el Ministro de Salud de Córdoba, Diego Cardozo, ratificó la tarea de estos organismos confirmando que hubo cambios en el funcionamiento.

En lo que respecta al COE Punilla, uno de sus integrantes, Sebastián Flores, aseguró que tanto "a nivel Provincia como de los departamentos, van a seguir funcionando con una nueva modalidad". Esto significa que el trabajo ya no se centra en lo que eran los permisos de circulación y trámites relacionados sino que se colabora en los operativos de vacunación y capacitación. Flores también dijo que las acciones está orientadas a lo que será la "segunda ola" de la pandemia.

La reestructuración de los COE se basa en un cambio no sólo en los nuevos requerimientos sanitarios, sino también en una modificación del organigrama.